În anii 1980, sistemul de operare cu interfață grafică a devenit tot mai accesibil și popular. Apple a fost printre pionierii acestui domeniu, lansând Apple Lisa în 1983, urmat de Macintosh în 1984. Aceste computere au introdus concepte precum desktop-ul, icoanele și meniurile, oferind utilizatorilor o experiență mult mai intuitivă decât ceea ce oferea până atunci textul în linie de comandă.

În același timp, Microsoft dezvolta sistemele de operare Windows, cu prima versiune lansată în 1985. Primele versiuni ale lui Windows, cum ar fi Windows 1.0 și 2.0, au fost mai puțin răspândite și mai limitate în funcționalitate, dar au servit drept baze pentru versiunile ulterioare care vor deveni extrem de populare.

Anii 1990 au adus o creștere semnificativă a popularității sistemelor de operare cu interfață grafică. Microsoft a lansat Windows 3.0 în 1990, care a adus îmbunătățiri semnificative în performanță și funcționalitate, și a urmat cu Windows 3.1 și Windows for Workgroups 3.11. Aceste versiuni au consolidat poziția lui Windows pe piață și au fost utilizate pe scară largă în întreaga lume.

În 1995, Microsoft a lansat Windows 95, un moment de cotitură în istoria sistemelor de operare cu interfață grafică. Windows 95 a introdus bara de start, care a oferit acces rapid la programe și fișiere, și a adus îmbunătățiri semnificative în stabilitate și performanță. Lansarea a fost un succes imens și a consolidat dominația lui Windows pe piața sistemelor de operare pentru următoarele decenii.

În timp ce Windows domina piața pentru calculatoare personale, Apple a continuat să își îmbunătățească sistemul de operare cu lansarea Mac OS 8 în 1997 și Mac OS 9 în 1999. Aceste versiuni au adus îmbunătățiri semnificative în performanță și funcționalitate pentru utilizatorii de Macintosh.

De asemenea, în anii 1990 au apărut primele consoale de jocuri video cu sisteme de operare grafice precum Sony PlayStation, Nintendo 64 și Sega Saturn. Acestea au introdus sisteme de operare mai sofisticate, necesare pentru a gestiona jocuri cu grafică 3D și alte funcții avansate.